Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG2P13727 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRG2P13727 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRG2P13727 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRG2P13727 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRG2P13727 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRG2P13727 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRG2P13727 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRG2P13727 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms