Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GP1BBP13224 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms