Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
VPREB1P12018 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms