Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI3P10071 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI3P10071 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI3P10071 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI3P10071 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI3P10071 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI3P10071 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI3P10071 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI3P10071 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI3P10071 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI3P10071 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI3P10071 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI3P10071 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI3P10071 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI3P10071 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GLI3P10071 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
GLI3P10071 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI3P10071 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI3P10071 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms