Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEFMP07197 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEFMP07197 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms