Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYBBP04839 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYBBP04839 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms