Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR1AO95602 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms