Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UFL1O94874 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UFL1O94874 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UFL1O94874 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UFL1O94874 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UFL1O94874 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UFL1O94874 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UFL1O94874 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UFL1O94874 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFL1O94874 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms