Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms