Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC28A2O43868 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms