Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms