Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LRRTM2O43300 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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