Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGFO15240 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGFO15240 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGFO15240 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VGFO15240 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VGFO15240 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VGFO15240 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VGFO15240 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGFO15240 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGFO15240 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGFO15240 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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