Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms