Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNPHO15079 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNPHO15079 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNPHO15079 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNPHO15079 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNPHO15079 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNPHO15079 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNPHO15079 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNPHO15079 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNPHO15079 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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