Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCF2LO15068 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms