Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRPO00591 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRPO00591 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRPO00591 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms