Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms