Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf172C9J069 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms