Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SOBPA7XYQ1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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