Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF316A6NFI3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms