Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMB4A4D0S4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LAMB4A4D0S4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms