Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F8A0AVK6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2F8A0AVK6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms