Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNPO3Q9Y5L0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNPO3Q9Y5L0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms