Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAXBP1Q9Y5B6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms