Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDGFL3Q9Y3E1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms