Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UTP11Q9Y3A2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms