Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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