Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM2AQ9Y2K7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM2AQ9Y2K7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms