Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DTX4Q9Y2E6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DTX4Q9Y2E6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms