Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP18Q9UMW8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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