Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLEC4AQ9UMR7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms