Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PACSIN3Q9UKS6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PACSIN3Q9UKS6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms