Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms