Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms