Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms