Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C19orf12Q9NSK7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms