Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms