Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMPRSS4Q9NRS4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms