Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTPS2Q9NRF8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms