Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms