Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB9BQ9NP90 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms