Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLIRPQ9GZT3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLIRPQ9GZT3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms