Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCL11BQ9C0K0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms