Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LNPKQ9C0E8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms