Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VN1R3Q9BXE9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms