Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SPATA9Q9BWV2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPATA9Q9BWV2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms