Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms