Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPS4Q9BT78 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COPS4Q9BT78 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms