Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT17Q9BSW7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT17Q9BSW7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT17Q9BSW7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT17Q9BSW7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT17Q9BSW7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms